MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 65450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021040	TGA	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201825
2	NC_021040	TGC	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201825
3	NC_021040	CAAAT	2	10	728	737	60 %	20 %	0 %	20 %	479201825
4	NC_021040	GAA	2	6	787	792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
5	NC_021040	GAAA	2	8	822	829	75 %	0 %	25 %	0 %	479201825
6	NC_021040	GAA	2	6	868	873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
7	NC_021040	TAG	2	6	989	994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201825
8	NC_021040	AAACTG	2	12	1048	1059	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479201825
9	NC_021040	GAA	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
10	NC_021040	TGT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201825
11	NC_021040	A	6	6	1229	1234	100 %	0 %	0 %	0 %	479201825
12	NC_021040	TAT	2	6	1245	1250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201825
13	NC_021040	AGA	2	6	1308	1313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201825
14	NC_021040	TAAA	2	8	1316	1323	75 %	25 %	0 %	0 %	479201825
15	NC_021040	AGG	2	6	1343	1348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201825
16	NC_021040	TAT	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
17	NC_021040	TAA	2	6	1399	1404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201826
18	NC_021040	ATT	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
19	NC_021040	AGT	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
20	NC_021040	TA	3	6	1465	1470	50 %	50 %	0 %	0 %	479201826
21	NC_021040	TAG	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
22	NC_021040	TAT	2	6	1584	1589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
23	NC_021040	TAT	2	6	1616	1621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
24	NC_021040	TGTC	2	8	1648	1655	0 %	50 %	25 %	25 %	479201826
25	NC_021040	A	6	6	1709	1714	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
26	NC_021040	TGAA	2	8	1717	1724	50 %	25 %	25 %	0 %	479201826
27	NC_021040	T	7	7	1771	1777	0 %	100 %	0 %	0 %	479201826
28	NC_021040	A	7	7	1806	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
29	NC_021040	CAT	2	6	1841	1846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201826
30	NC_021040	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201826
31	NC_021040	ATT	2	6	1921	1926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
32	NC_021040	TG	3	6	1927	1932	0 %	50 %	50 %	0 %	479201826
33	NC_021040	AGC	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201826
34	NC_021040	A	6	6	2078	2083	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
35	NC_021040	ATG	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
36	NC_021040	A	6	6	2164	2169	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
37	NC_021040	CAA	2	6	2185	2190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201826
38	NC_021040	AG	3	6	2196	2201	50 %	0 %	50 %	0 %	479201826
39	NC_021040	TTG	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201826
40	NC_021040	CTT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479201826
41	NC_021040	GA	3	6	2282	2287	50 %	0 %	50 %	0 %	479201826
42	NC_021040	AGAT	2	8	2311	2318	50 %	25 %	25 %	0 %	479201826
43	NC_021040	TGAATT	2	12	2323	2334	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	479201826
44	NC_021040	TTA	2	6	2373	2378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201826
45	NC_021040	AT	3	6	2420	2425	50 %	50 %	0 %	0 %	479201826
46	NC_021040	TCATA	2	10	2442	2451	40 %	40 %	0 %	20 %	479201826
47	NC_021040	GAT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
48	NC_021040	AAT	2	6	2475	2480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201826
49	NC_021040	A	7	7	2528	2534	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
50	NC_021040	TGG	2	6	2535	2540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201826
51	NC_021040	CTG	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201826
52	NC_021040	A	7	7	2571	2577	100 %	0 %	0 %	0 %	479201826
53	NC_021040	ATG	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201826
54	NC_021040	GGA	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201827
55	NC_021040	GAA	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201827
56	NC_021040	ATA	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201827
57	NC_021040	ATG	3	9	2984	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201827
58	NC_021040	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201827
59	NC_021040	CAG	2	6	3132	3137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201827
60	NC_021040	ATG	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201827
61	NC_021040	CAA	2	6	3264	3269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201827
62	NC_021040	GTT	2	6	3329	3334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201827
63	NC_021040	AAT	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201827
64	NC_021040	TAAAA	2	10	3414	3423	80 %	20 %	0 %	0 %	479201827
65	NC_021040	A	6	6	3420	3425	100 %	0 %	0 %	0 %	479201827
66	NC_021040	TTTAA	2	10	4514	4523	40 %	60 %	0 %	0 %	479201828
67	NC_021040	ATAA	2	8	4535	4542	75 %	25 %	0 %	0 %	479201828
68	NC_021040	AAT	2	6	4543	4548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201828
69	NC_021040	GCA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201828
70	NC_021040	CAT	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201828
71	NC_021040	CAT	2	6	4629	4634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201828
72	NC_021040	AAG	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201828
73	NC_021040	GGA	2	6	4769	4774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201828
74	NC_021040	TTACAA	2	12	4800	4811	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	479201828
75	NC_021040	GTG	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201828
76	NC_021040	AGTT	2	8	4834	4841	25 %	50 %	25 %	0 %	479201828
77	NC_021040	CAAC	2	8	4863	4870	50 %	0 %	0 %	50 %	479201828
78	NC_021040	AGC	2	6	4888	4893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201828
79	NC_021040	AGA	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201828
80	NC_021040	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201829
81	NC_021040	AGAGAT	2	12	5485	5496	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	479201829
82	NC_021040	ATA	2	6	5514	5519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201829
83	NC_021040	ATT	2	6	5615	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201829
84	NC_021040	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201829
85	NC_021040	AATAG	2	10	5669	5678	60 %	20 %	20 %	0 %	479201829
86	NC_021040	ACA	2	6	5689	5694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201829
87	NC_021040	AGA	2	6	5713	5718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201829
88	NC_021040	AATTG	2	10	5719	5728	40 %	40 %	20 %	0 %	479201829
89	NC_021040	AT	3	6	5852	5857	50 %	50 %	0 %	0 %	479201829
90	NC_021040	GTT	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201829
91	NC_021040	TGA	2	6	5872	5877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201829
92	NC_021040	AAG	2	6	5994	5999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201829
93	NC_021040	ATTTA	2	10	6003	6012	40 %	60 %	0 %	0 %	479201829
94	NC_021040	TAAA	2	8	6126	6133	75 %	25 %	0 %	0 %	479201829
95	NC_021040	ATT	2	6	6159	6164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201829
96	NC_021040	T	7	7	6195	6201	0 %	100 %	0 %	0 %	479201829
97	NC_021040	T	7	7	6213	6219	0 %	100 %	0 %	0 %	479201829
98	NC_021040	AGT	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201829
99	NC_021040	T	7	7	6678	6684	0 %	100 %	0 %	0 %	479201830
100	NC_021040	AT	3	6	6734	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	479201830
101	NC_021040	GAT	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201830
102	NC_021040	TCA	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201830
103	NC_021040	TAA	2	6	6787	6792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201830
104	NC_021040	A	7	7	6814	6820	100 %	0 %	0 %	0 %	479201830
105	NC_021040	A	6	6	6834	6839	100 %	0 %	0 %	0 %	479201830
106	NC_021040	AGAAAA	2	12	6868	6879	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	479201830
107	NC_021040	A	6	6	6876	6881	100 %	0 %	0 %	0 %	479201830
108	NC_021040	AGG	2	6	6884	6889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201830
109	NC_021040	A	6	6	6902	6907	100 %	0 %	0 %	0 %	479201831
110	NC_021040	ATG	2	6	6912	6917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201831
111	NC_021040	AGC	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479201831
112	NC_021040	GAAA	3	12	7030	7041	75 %	0 %	25 %	0 %	479201831
113	NC_021040	ATA	2	6	7042	7047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201831
114	NC_021040	GGT	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201832
115	NC_021040	CATA	2	8	7179	7186	50 %	25 %	0 %	25 %	479201832
116	NC_021040	TATT	2	8	7298	7305	25 %	75 %	0 %	0 %	479201832
117	NC_021040	GTT	2	6	7319	7324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479201832
118	NC_021040	ATTTGC	2	12	7402	7413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479201832
119	NC_021040	GAAAAT	2	12	7421	7432	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	479201832
120	NC_021040	A	6	6	7457	7462	100 %	0 %	0 %	0 %	479201832
121	NC_021040	TAA	2	6	7479	7484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201832
122	NC_021040	ATT	2	6	7508	7513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201832
123	NC_021040	CA	3	6	7518	7523	50 %	0 %	0 %	50 %	479201832
124	NC_021040	TTA	2	6	7550	7555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201832
125	NC_021040	TGC	2	6	7570	7575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479201832
126	NC_021040	ACT	2	6	7576	7581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479201832
127	NC_021040	TG	3	6	7587	7592	0 %	50 %	50 %	0 %	479201832
128	NC_021040	A	6	6	7620	7625	100 %	0 %	0 %	0 %	479201832
129	NC_021040	TGTTA	2	10	7770	7779	20 %	60 %	20 %	0 %	479201833
130	NC_021040	TAT	2	6	7823	7828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201833
131	NC_021040	AGG	2	6	7865	7870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201833
132	NC_021040	GA	4	8	7872	7879	50 %	0 %	50 %	0 %	479201833
133	NC_021040	TAA	2	6	7891	7896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201833
134	NC_021040	AAG	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201834
135	NC_021040	A	7	7	8009	8015	100 %	0 %	0 %	0 %	479201834
136	NC_021040	AAAT	2	8	8089	8096	75 %	25 %	0 %	0 %	479201835
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266	NC_021040	AGA	2	6	17184	17189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201843
267	NC_021040	A	6	6	17218	17223	100 %	0 %	0 %	0 %	479201843
268	NC_021040	GAA	2	6	17236	17241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201843
269	NC_021040	GA	4	8	17257	17264	50 %	0 %	50 %	0 %	479201843
270	NC_021040	GAG	2	6	17281	17286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479201843
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277	NC_021040	ATG	2	6	17555	17560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201844
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290	NC_021040	GAA	2	6	18112	18117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479201844
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372	NC_021040	T	6	6	22006	22011	0 %	100 %	0 %	0 %	479201847
373	NC_021040	AAT	2	6	22060	22065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479201847
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375	NC_021040	TGG	2	6	22190	22195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479201847
376	NC_021040	TTA	2	6	22216	22221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201847
377	NC_021040	AAC	2	6	22277	22282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201847
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382	NC_021040	AAGA	2	8	22811	22818	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
383	NC_021040	GAAG	2	8	22942	22949	50 %	0 %	50 %	0 %	479201848
384	NC_021040	AAAG	2	8	22954	22961	75 %	0 %	25 %	0 %	479201848
385	NC_021040	AACA	2	8	23216	23223	75 %	0 %	0 %	25 %	479201849
386	NC_021040	T	7	7	23230	23236	0 %	100 %	0 %	0 %	479201849
387	NC_021040	ATT	2	6	23265	23270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479201849
388	NC_021040	ACTG	2	8	23279	23286	25 %	25 %	25 %	25 %	479201849
389	NC_021040	ATG	2	6	23356	23361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201849
390	NC_021040	ATG	2	6	23379	23384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201849
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392	NC_021040	ACA	2	6	23436	23441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479201849
393	NC_021040	ATG	2	6	23565	23570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479201849
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395	NC_021040	G	7	7	23650	23656	0 %	0 %	100 %	0 %	479201849
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